Cluster Analysis Service
Service description Hierarchical grouping of relevant genes Cluster Analysis サービスでは、発現プロファイルの相似性に基づいて関連遺伝子をグループ分けします：遺伝子は階層ツリー状にグループ分けされ、そこでは発現プロファイルの類似している遺伝子同士は近くに配置され、異なる制御を受けている遺伝子同士は遠くに配置されます。顕著な遺伝子グループや実験に関しては、Pathway Analysis Service でさらに検証することが出来ます。 バイオインフォマティクスサービスには、少なくとも ４マイクロアレイ実験 (sample vs. control) のデータが必要です。下記の “File formats for data analysis” に記載のリクエストをお読みになり、発現データをお送りください。 Package includes １セットのサンプル及び遺伝子の階層クラスタリング： • 共調節されている遺伝子のグルーピング • 手順と最も重要な結果を記載したレポート書類 (適応可能な場合、以下を含みます）： - Identification of most relevant clusters - Clustered heat maps (graphics format) - Heatmap-coded file of processed data - Supplementary CD/DVD-ROM - レポート書類 (PDF format)		Figure 1 Cluster Analysis The cluster shows correlated groups of genes and experiments. Neighboring genes or experiments in the tree are similar, distant ones are different from each other. In samples L, H, and D, all genes are upregulated. In samples B, K, F, J, G, and C, one cluster of genes in the upper third of graph is also upregulated. This coexpression group is fairly distant from the genes combined to clusters found in the lower third of the heat map which are all downregulated in samples I, E, A, B, K, F, J, G, and C, and only upregulated in samples L, H, and D. Red: induction, green: repression, grey: no data, black: no differential regulation.

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